Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vwa8Q8CC88 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vwa8Q8CC88 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Vwa8Q8CC88 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Vwa8Q8CC88 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Vwa8Q8CC88 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Vwa8Q8CC88 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Vwa8Q8CC88 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vwa8Q8CC88 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms