Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SynpoQ8CC35 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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