Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ephb1Q8CBF3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms