Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfibp1Q8C8U0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfibp1Q8C8U0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ppfibp1Q8C8U0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ppfibp1Q8C8U0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms