Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q8C5C9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms