Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ccdc90bQ8C3X2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc90bQ8C3X2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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