Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trim35Q8C006 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Trim35Q8C006 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim35Q8C006 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim35Q8C006 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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