Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp5Q8BX09 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbbp5Q8BX09 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms