Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdcl3Q8BVF2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms