Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cops7bQ8BV13 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops7bQ8BV13 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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