Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Cnpy4Q8BQ47 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cnpy4Q8BQ47 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Cnpy4Q8BQ47 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Cnpy4Q8BQ47 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnpy4Q8BQ47 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms