Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c4Q8BMQ2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms