Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gga3Q8BMI3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gga3Q8BMI3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms