Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpc2Q8BKV1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc2Q8BKV1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms