Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pum3Q8BKS9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pum3Q8BKS9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms