Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarcal1Q8BJL0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarcal1Q8BJL0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms