Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmco3Q8BH01 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms