Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Ubash3bQ8BGG7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ubash3bQ8BGG7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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