Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trmt12Q8BG71 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trmt12Q8BG71 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms