Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms