Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc172Q810N9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc172Q810N9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms