Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ChfrQ810L3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChfrQ810L3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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