Protein–RNA interactions for Protein: Q810J8

Zfyve1, Zinc finger FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve1Q810J8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Zfyve1Q810J8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zfyve1Q810J8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms