Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chn2Q80XD1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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