Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc116Q80X53 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc116Q80X53 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc116Q80X53 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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