Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cfap100Q80VN0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cfap100Q80VN0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms