Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc29Q80VM3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc29Q80VM3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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