Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SnphQ80U23 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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