Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Clec18aQ7TSQ1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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