Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ClmQ7TSN2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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