Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prrc2bQ7TPM1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prrc2bQ7TPM1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms