Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp397Q7TNK4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp397Q7TNK4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms