Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf139Q7TMV1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms