Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Scn4bQ7M729 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn4bQ7M729 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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