Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ScocQ78YZ6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ScocQ78YZ6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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