Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TwistnbQ78WZ7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms