Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snd1Q78PY7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snd1Q78PY7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms