Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja6Q6S5G4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms