Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rad54bQ6PFE3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms