Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtifQ6PEE2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtifQ6PEE2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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