Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
BC061212Q6P8K3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms