Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Podnl1Q6P3Y9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Podnl1Q6P3Y9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms