Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RbfaQ6P3B9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms