Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krba1Q6NXZ1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krba1Q6NXZ1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms