Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh1Q6IUP1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh1Q6IUP1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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