Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm4Q6IRU2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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