Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Carmil1Q6EDY6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Carmil1Q6EDY6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms