Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pram1Q6BCL1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pram1Q6BCL1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms