Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Cep290Q6A078 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cep290Q6A078 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cep290Q6A078 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cep290Q6A078 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cep290Q6A078 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep290Q6A078 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms