Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sv2cQ69ZS6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sv2cQ69ZS6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms